Trifolium aureum Pollich, 1777

Cette espèce est répartie de manière très disséminée dans presque toute la région, mais manque en Bresse, dans le Val d’Amour, et est très rare en plaine doloise à Dampierre et Santans, en plaine de Gray à Fretigney-et-Velloreille, sur les plateaux calcaires de l’ouest de la Haute-Saône à Oyrières, les monts de Gy à Courcuire, dans le Pays d’Amance à Polaincourt-et-Clairefontaine, le Sundgau à Chavanatte, sur les seconds plateaux du Doubs et du Jura à Courvières, Villers-sous-Chalamont, Gevresin et Sirop, ainsi que dans le Jura plissé à Mouthe, Châtelblanc, Foncine-le-Haut, Lézat, Septmoncel, Choux et aux Moussières. Elle est ensuite disséminée en Petite Montagne, sur les premiers plateaux, dans le faisceau de Quingey, la moyenne vallée du Doubs, le Pays de Montbéliard, les Vosges comtoises, la dépression sous-vosgienne et sur les plateaux calcaires de Vesoul.

Le trèfle doré est une plante de mi-ombre, mais qui se développe parfois en pleine lumière. Il apprécie des sols frais à assez secs, neutres à acides et plus ou moins mésotrophes. C’est une espèce des lisières, des ourlets et des chemins forestiers qui fréquente les communautés des Epilobietea angustifolii. On l’observe également dans des prairies en déprise, des pelouses mésophiles à mésoxérophiles (Mesobromion erecti), ainsi que dans les fonds d’étang en assec.